Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms