Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms