Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TBRG1Q3YBR2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms