Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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