Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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KRTAP21-3Q3LHN1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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KRTAP21-3Q3LHN1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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KRTAP21-3Q3LHN1 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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KRTAP21-3Q3LHN1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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KRTAP21-3Q3LHN1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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KRTAP21-3Q3LHN1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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