Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms