Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRFIP1Q32MZ4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms