Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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PTPRNQ16849 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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PTPRNQ16849 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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PTPRNQ16849 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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PTPRNQ16849 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRNQ16849 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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