Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA3Q16787 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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