Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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SNAPC1Q16533 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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SNAPC1Q16533 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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SNAPC1Q16533 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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SNAPC1Q16533 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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