Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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TNXAQ16473 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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TNXAQ16473 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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TNXAQ16473 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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TNXAQ16473 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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TNXAQ16473 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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TNXAQ16473 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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TNXAQ16473 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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TNXAQ16473 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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TNXAQ16473 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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TNXAQ16473 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNXAQ16473 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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