Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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CNGA3Q16281 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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CNGA3Q16281 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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CNGA3Q16281 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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