Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZIC1Q15915 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms