Protein–RNA interactions for Protein: Q15714

TSC22D1, TSC22 domain family protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC22D1Q15714 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TSC22D1Q15714 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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