Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
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