Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TWIST1Q15672 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms