Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCEA2Q15560 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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