Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SYCP1Q15431 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
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SYCP1Q15431 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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SYCP1Q15431 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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SYCP1Q15431 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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SYCP1Q15431 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP1Q15431 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
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