Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RYR3Q15413 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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