Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NCF4Q15080 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NCF4Q15080 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NCF4Q15080 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NCF4Q15080 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NCF4Q15080 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NCF4Q15080 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NCF4Q15080 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NCF4Q15080 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms