Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
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