Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHPRHQ149N8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
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