Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL19A1Q14993 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
COL19A1Q14993 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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COL19A1Q14993 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL19A1Q14993 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
COL19A1Q14993 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL19A1Q14993 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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COL19A1Q14993 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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COL19A1Q14993 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL19A1Q14993 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL19A1Q14993 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL19A1Q14993 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL19A1Q14993 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL19A1Q14993 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL19A1Q14993 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL19A1Q14993 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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COL19A1Q14993 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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COL19A1Q14993 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL19A1Q14993 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL19A1Q14993 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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COL19A1Q14993 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL19A1Q14993 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
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COL19A1Q14993 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
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COL19A1Q14993 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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COL19A1Q14993 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL19A1Q14993 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL19A1Q14993 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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COL19A1Q14993 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL19A1Q14993 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL19A1Q14993 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL19A1Q14993 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL19A1Q14993 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
COL19A1Q14993 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL19A1Q14993 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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COL19A1Q14993 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL19A1Q14993 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL19A1Q14993 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL19A1Q14993 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL19A1Q14993 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL19A1Q14993 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL19A1Q14993 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL19A1Q14993 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL19A1Q14993 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL19A1Q14993 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL19A1Q14993 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL19A1Q14993 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL19A1Q14993 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL19A1Q14993 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL19A1Q14993 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL19A1Q14993 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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