Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms