Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERV3-1Q14264 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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