Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
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