Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CDK13Q14004 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDK13Q14004 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
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