Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCINQ13939 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCINQ13939 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCINQ13939 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCINQ13939 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCINQ13939 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CCINQ13939 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCINQ13939 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCINQ13939 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCINQ13939 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCINQ13939 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCINQ13939 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCINQ13939 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCINQ13939 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCINQ13939 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCINQ13939 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCINQ13939 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CCINQ13939 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCINQ13939 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCINQ13939 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCINQ13939 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCINQ13939 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCINQ13939 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCINQ13939 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCINQ13939 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCINQ13939 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCINQ13939 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCINQ13939 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCINQ13939 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCINQ13939 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCINQ13939 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCINQ13939 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCINQ13939 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCINQ13939 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCINQ13939 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCINQ13939 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCINQ13939 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCINQ13939 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCINQ13939 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCINQ13939 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCINQ13939 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCINQ13939 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCINQ13939 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCINQ13939 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCINQ13939 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCINQ13939 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCINQ13939 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCINQ13939 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCINQ13939 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCINQ13939 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCINQ13939 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCINQ13939 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCINQ13939 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCINQ13939 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCINQ13939 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCINQ13939 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCINQ13939 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCINQ13939 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCINQ13939 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCINQ13939 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCINQ13939 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCINQ13939 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCINQ13939 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCINQ13939 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCINQ13939 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCINQ13939 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCINQ13939 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCINQ13939 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCINQ13939 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCINQ13939 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCINQ13939 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCINQ13939 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCINQ13939 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCINQ13939 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCINQ13939 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCINQ13939 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCINQ13939 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCINQ13939 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCINQ13939 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCINQ13939 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCINQ13939 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCINQ13939 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCINQ13939 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCINQ13939 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCINQ13939 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCINQ13939 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCINQ13939 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCINQ13939 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCINQ13939 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCINQ13939 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCINQ13939 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCINQ13939 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCINQ13939 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCINQ13939 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCINQ13939 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCINQ13939 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCINQ13939 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCINQ13939 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCINQ13939 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCINQ13939 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms