Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms