Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
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NAE1Q13564 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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NAE1Q13564 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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NAE1Q13564 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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