Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms