Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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PRPF4BQ13523 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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PRPF4BQ13523 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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PRPF4BQ13523 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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