Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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