Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
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