Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
GRIN2BQ13224 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
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