Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
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