Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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