Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms