Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ABCC8Q09428 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms