Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms