Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms