Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL16A1Q07092 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms