Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms