Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ATP7AQ04656 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms