Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSC2Q02487 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
DSC2Q02487 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSC2Q02487 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSC2Q02487 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSC2Q02487 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSC2Q02487 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSC2Q02487 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSC2Q02487 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSC2Q02487 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSC2Q02487 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSC2Q02487 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSC2Q02487 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
DSC2Q02487 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSC2Q02487 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
DSC2Q02487 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
DSC2Q02487 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSC2Q02487 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSC2Q02487 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSC2Q02487 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSC2Q02487 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSC2Q02487 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSC2Q02487 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSC2Q02487 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSC2Q02487 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSC2Q02487 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSC2Q02487 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSC2Q02487 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DSC2Q02487 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DSC2Q02487 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DSC2Q02487 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DSC2Q02487 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DSC2Q02487 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DSC2Q02487 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DSC2Q02487 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DSC2Q02487 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DSC2Q02487 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms