Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A2Q01362 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms