Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms