Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD1P98174 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD1P98174 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD1P98174 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD1P98174 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD1P98174 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD1P98174 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD1P98174 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD1P98174 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD1P98174 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD1P98174 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD1P98174 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD1P98174 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD1P98174 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD1P98174 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD1P98174 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD1P98174 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD1P98174 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD1P98174 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD1P98174 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD1P98174 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD1P98174 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD1P98174 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD1P98174 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD1P98174 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD1P98174 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD1P98174 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD1P98174 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD1P98174 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD1P98174 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD1P98174 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD1P98174 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD1P98174 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD1P98174 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD1P98174 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD1P98174 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD1P98174 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD1P98174 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD1P98174 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD1P98174 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD1P98174 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD1P98174 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD1P98174 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD1P98174 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD1P98174 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD1P98174 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD1P98174 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD1P98174 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD1P98174 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD1P98174 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD1P98174 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD1P98174 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD1P98174 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD1P98174 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD1P98174 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD1P98174 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD1P98174 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD1P98174 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD1P98174 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD1P98174 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD1P98174 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD1P98174 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD1P98174 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD1P98174 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD1P98174 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD1P98174 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD1P98174 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD1P98174 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD1P98174 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD1P98174 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD1P98174 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD1P98174 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD1P98174 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD1P98174 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD1P98174 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD1P98174 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD1P98174 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD1P98174 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD1P98174 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD1P98174 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD1P98174 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD1P98174 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD1P98174 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD1P98174 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD1P98174 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD1P98174 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD1P98174 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD1P98174 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD1P98174 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD1P98174 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD1P98174 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD1P98174 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
FGD1P98174 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FGD1P98174 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FGD1P98174 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
FGD1P98174 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGD1P98174 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGD1P98174 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGD1P98174 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGD1P98174 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms