Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCCD1P59942 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCCD1P59942 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCCD1P59942 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCCD1P59942 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCCD1P59942 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCCD1P59942 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCCD1P59942 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCCD1P59942 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCCD1P59942 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCCD1P59942 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCCD1P59942 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCCD1P59942 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCCD1P59942 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCCD1P59942 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCCD1P59942 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCCD1P59942 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MCCD1P59942 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCCD1P59942 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MCCD1P59942 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCCD1P59942 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCCD1P59942 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCCD1P59942 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCCD1P59942 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCCD1P59942 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCCD1P59942 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCCD1P59942 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCCD1P59942 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCCD1P59942 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCCD1P59942 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCCD1P59942 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCCD1P59942 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCCD1P59942 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCCD1P59942 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCCD1P59942 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MCCD1P59942 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCCD1P59942 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCCD1P59942 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCCD1P59942 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms