Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms